Comparativement aux régions du sud et du centre du Mali, l’excision est pratiquée dans la région de Tombouctou à un niveau moins élevé au sein des femmes en âge de procréer. En effet, la pratique concerne la moitié des femmes en âge de procréer (50,1%) selon le rapport de l’EDSM VI, 2018.

Les types d’excision pratiqués dans la région sont : entaille sans enlever de chair (21,5% des cas) ; les parties de la chair enlevée (58,4%) et la fermeture du vagin (3,1%). Dans cette zone administrative, l’excision est pratiquée avant l’âge de 10 ans (87%). A Tombouctou, la proportion des filles de moins de 15 ans excisées est de 29%.